Enquanto fãs aguardam ansiosamente a adaptação em anime de Sakamoto Days, o mangá avança com o nono arco da história, o Arco da Prisão da JAA. Shin e Heisuke se infiltram na prisão da Associação Japonesa de Assassinos (JAA) em busca da Vidente, que está cumprindo sua sentença. Atari, ex-membro da Ordem, foi presa após cometer erros durante as atividades de X.
Durante a missão, Shin e Heisuke encontram Tenkyu, que planeja se reconciliar com Uzuki. Tenkyu acredita que matar a família Sakamoto trará felicidade a Uzuki, mas seus planos são frustrados. Shin e Heisuke também cruzam o caminho de Atari, que pretende escapar da prisão com eles. No entanto, Shin decide tomar as rédeas da situação e confrontar Tenkyu, derrotando-o no capítulo 194.
Quando Shin está prestes a dar o golpe final, Taro aparece e o impede de cometer um ato impensável. No capítulo 195, Taro expressa sua preocupação com o futuro de Shin, que se sente um pessoa horrível. O capítulo encerra com um vislumbre do passado de Shin e Taro, cerca de oito anos atrás.
Desde o primeiro capítulo, Shin idolatra Taro como um herói em Sakamoto Days. Ele sempre se mostrou disposto a sacrificar sua vida por Taro. Em contrapartida, Taro confia plenamente em Shin, abrigando-o em sua casa quando necessário. A relação entre eles nunca foi explorada a fundo no mangá, e sempre existiu uma dúvida sobre a origem da admiração de Shin por Taro. A história revelará que Shin conheceu Taro aos 13 anos, quando este tinha 19 anos, e o capítulo 196 promete aprofundar esse relacionamento.
O ataque à Exposição coloca Taro, Shin e Uzuki na mira da JAA. Nagumo se junta ao grupo de Taro após ser expulso da Ordem. Após o incidente, Taro continua sendo alvo da JAA, o que impede até mesmo coisas simples, como comprar um bolo de aniversário para sua filha. A situação se agrava com os ataques de assassinos, que prejudicam seu comércio. Taro conclui que sua família não terá paz enquanto a JAA existir.
A Associação Japonesa de Assassinos, ou JAA, é uma organização antagônica na trama. Oficialmente reconhecida pelo governo, ela se envolve em negócios obscuros. O presidente Sei Asaki é o vilão principal de Sakamoto Days. Ele forçava órfãos a reprimir suas emoções para se tornarem assassinos cruéis. Asaki também orquestrou a morte de Rion nas mãos de Uzuki, para traumatizar seu irmão mais novo.
Taro planeja assumir o controle da JAA e transformar sua loja em uma rede nacional. Embora a ideia pareça distante, Shin e os demais membros estão dispostos a ajudá-lo. Para isso, eles precisam aprimorar suas habilidades. Enquanto Taro treina com Torres, Shin decide melhorar suas capacidades com a ajuda de Atari. A batalha contra a JAA deve começar logo após o Arco da Prisão da JAA.
